Leiden heeft in totaal 8 stadspoorteen gehad, de Morspoort samen met de Zeilpoort zijn de enige twee poorten die er vandaag de dag nog zijn. Deze stadspoort dateert uit 1669 en is ontworpen door de Leidse stadsbouwmeester Willem van der Helm.

Op de plaats van de huidige variant van de Morspoort stond eerst een houten bouwwerk, dit werd geplaats toen Leiden zich aan de noord kant uitbreidde in 1609.  De Morspoort was een multifunctioneel gebouw. De poort diende ook lange tijd als gevangenis. 

In 1817 werd er naast de Morspoort de Morspoortkazerne gebouwd. In de kazerne verbleven tot aan 1940 infanterie. Na jarenlang een belangrijke rol te hebben gehad in de Nederlandse defensie verloor Leiden in 1981 zijn laatste landmacht vertegenwoordiging.